Опасность жизни и здоровью туристов подстерегает в Негомбо разве что на дорогах, где автобусы конкурирующих фирм часто нарушают правила движения, борясь за каждого клиента. Также мало продуманным в плане безопасности пассажиров является такой городской транспорт, как тук-туки.
В остальном туристам стоит переживать за свои материальные ценности. Кражи здесь случаются не только на улицах, но даже в номерах отелей, в том числе из сейфов. В этом плане безопасность в Негомбо оставляет желать лучшего.
Кроме этого, туристы часто оказываются жертвами мошенничества. Типичное явление, когда туристам продают дорогие билеты на несуществующие услуги. Даже в храмах можно наткнуться на поддельных монахов или настоятелей.
Также не рекомендуется путешествовать по зонам, не предназначенным для туристов. После недавно утихшей гражданской войны некоторые территории остаются заминированными.